开办药品批发企业能够按第三方物流申报跨省托付跨省配送吗

这个是能够的。
省内药品批发企业可不设药品库房，托付省内具有药品托付贮存配送资质的药品现代物流企业贮存配送药品，省内外药品出产企业及外省药品批发企业也可托付省内具有药品托付贮存配送资质的药品现代物流企业贮存配送药品，外省药品批发企业仅限与某药品出产企业一起隶属于同一企业集团的全资控股子公司且托付贮存配送规模仅限该药品出产企业出产的药品，省内药品零售连锁企业总部可不设药品库房，委托省内具有药品托付贮存配送资质的药品现代物流企业贮存配送药品，但配送服务仅限于向零售连锁企业所属门店配送，不得向个人顾客配送。