公司物流系统构成的垂直结构，即通过（）的协调配合达成其总体功能。

A

解析：

公司物流系统构成的垂直结构即管理层、控制层和作业层，物流系统通过这三个层次的协调配合达成其总体功能。管理层的任务是对整个物流系统进行统一的计划、实施和控制；控制层的任务是控制物料流动过程，主要包括订货处理与顾客服务、库存计划与控制、生产计划与控制、用料管理、采购等；作业层的任务是完成物料的时间转移和空间转移，主要包括发货与进货运输、装卸搬运、包装、保管、流通加工等。