PuppyLinux 支持的软件包括但不限于：
浏览器：Firefox、Chromium、Seamonkey办公套件：LibreOffice、AbiWord、Gnumeric图像处理软件：GIMP、Inkscape音频/视频播放器：VLC、Audacious、MPlayer轻量级文本编辑器：Geany、Leafpad系统工具：GParted、Htop、Grsync图形界面配置工具：Puppy Package Manager、Quickpet轻量级终端：Urxvt、LXTerminalPDF阅读器：Xpdf、Evince此外，PuppyLinux 还支持通过其自带的 SFS（Squash File System）模块来扩展软件支持范围，用户可以安装各种额外的软件包来满足自己的需求。
